1919年（大正8年）、初代社長末松清一他107名の株主により、資本金百万円の株式組織で日本調味料醸造株式会社の社名で現在の地に創立しました。

昭和初期には、当時の満州、朝鮮半島など海外進出を遂げ、生産販売面で飛躍し、広くニビシの名声を博するに至りました。

その後、1965年（昭和40年）、社名を現在のニビシ醤油株式会社に変更、また、資本金も増資及び合併を行い、1966年（昭和41年)には90百万円になりました。1959年（昭和34年）には、「無手入製麹装置」を発明し、その技術を公開、業界の技術発展に貢献しました。

1970年（昭和45年）には、柳川工場を古賀工場に統合し、工場設備の改善拡充をはかり、「醸造製品は生き物である」をモットーに技術の研鑽と品質の万全の管理に努めています。

1976年（昭和51年)には、営業部門の組織を変更し、独立の販売会社を設立。各地域への供給・サービスに万全を期すため販売網の拡充を図りました。

2016年（平成28年）には瓶詰工場、第五工場、製品倉庫を新設。
瓶詰工場では、つゆ、だし類のペットボトル化をはじめ、鮮度ボトル製品など各種容器に対応できる設備を導入し、商品ラインナップの拡充と併せて生産性の向上を実現しました。
また第五工場は、鍋スープやラーメン・ちゃんぽんスープなどを、より衛生的な環境で製造することを可能にしたほか、今後の新分野への試みを可能とした環境を整備しました。

• 瓶詰工場

• 第五工場